José Filipe Alves colabora na Universidade do Porto há aproximadamente duas décadas e integra o CSIRT.UPORTO (Unidade de Segurança da Informação) desde 2015.
É Presidente Eleito da European Campus Card Association (ECCA) para o próximo triénio, onde desde 2019 desempenhou funções de Secretário Geral.
Está envolvido em projetos estruturantes na área da Identidade e Transformação Digital, de entre os quais o projeto Digital Credentials for Europe (DC4EU) do qual a Universidade do Porto é parte integrante.